بر اساس تبصره ۱ ماده ۸۰ قانون انتخابات ریاستجمهوری، چنانچه کسانی از نحوه برگزاری انتخابات شکایت داشتند، میتوانستند ظرف مدت سه روز از تاریخ اخذ رأی، شکایت مستند خود را به هیاتهای نظارت استانها و شهرستانها یا دبیرخانه شورای نگهبان ارائه کنند.
پس از پایان مهلت سه روزه، طبق ماده ۷۹ قانون انتخابات ریاستجمهوری شورای نگهبان ظرف یک هفته و در صورت ضرورت حداکثر ده روز پس از دریافت نتیجه انتخابات ریاستجمهوری نظر قطعی خود را نسبت به انتخابات انجام شده به وزارت کشور اعلام میکند و وزارت کشور از طریق رسانههای گروهی نتیجه نهایی را به اطلاع مردم خواهد رساند.
گفتنی است ابراهیم رئیسی پس از اعلام نتایج و مسجل شدن پیروزی رقیب به ستاد انتخابات در وزارت کشور مراجعه کرد و اعتراض خود را نسبت به برخی تخلفات در برخی از شعب رایگیری اعلام کرد.